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【论著】基因型1a丙型肝炎病毒在北美的传播:一项回顾性系统发育研究

2016-09-25 13:28点击:268发表评论
作者:Jeffrey B Joy, Rosemary M McCloskey, Thuy Nguyen, Richard H Liang, Yury Khudyakov, Andrea Olmstead, Mel Krajden, John W Ward, P Richard harrigan, Julio S G Montaner, Art F Y Poon
期刊:The Lancet Infectious Diseases CN》2016年3期

背景 基因型1a丙型肝炎病毒最初在北美传播的时间目前尚有争议,特别是丙型肝炎病毒感染何时以何种方式在特定人群中达到了惊人的患病率仍尚未明确。本研究使用所有可获得的丙型肝炎病毒序列数据,通过采用动态发育方法,对基因型1a丙型肝炎病毒在北美的传播时间进行了量化分析。

方法 我们对可公开获取的45 316个基因型1a丙型肝炎病毒序列的位置和基因型信息进行了筛查,随后对所有可在北美获取的5个丙型肝炎病毒基因(E1E2NS2NS4BNS5B)序列进行系统发育分析, 并强调尽可能多的收集采样日期较早的序列。我们使用贝叶斯天际线点图推断了所有5个基因区域流行的历史人群动态。

结果 在北美绝大多数基因型1a丙型肝炎病毒传播发生于1965年以前,此后丙型肝炎病毒的流行扩散强度相对较小。北美丙型肝炎流行的有效人群数量在1960年左右趋于稳定。这些结果对于所分析的5 个基因区域而言均很明显,尽管针对各基因单独进行的分析显示,它们的早期指数增长时间估计结果差异较大(范围从NS2的1942年到NS4B的1965年)。

结论 1965年以前基因型1a的扩散情况表明,院内或医源性因素为丙型肝炎病毒在北美地区流行的主要原因,而非过去认为的偶发危险行为(即实验性注射毒品、不安全的纹身、高风险性行为及前往高发区)。这些研究结果可能会减少丙型肝炎病毒筛查和诊断相关的偏见,在无形中提高了这一疾病的筛查率和治疗率。

研究资金来源 加拿大卫生研究院,迈克尔•史密斯健康研究基金会及不列颠哥伦比亚艾滋病示范中心。

关键词:TLID_I 2016年3月 论著


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《柳叶刀感染性疾病杂志(中文版)》

为推动我国疾病预防控制和感染性疾病领域临床工作的进一步发展,并为公共卫生专业人士及临床医师提供权威、优质的学术资讯,全球最大的医学出版集团爱思唯尔(Elsevier)于2012年启动了《柳叶刀感染性疾病杂志(中文版)》的出版工作。
《柳叶刀感染性疾病杂志(中文版)》内容源自 The Lancet Infectious Disease原刊,隶属国际顶级医学期刊The Lancet,在全球感染性疾病领域拥有最高的影响因子(2015年IF:21.372)。

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  • 王宇
    王宇

    现任中国疾病预防控制中心主任,研究员,博士生导师。兼任中华预防医学会副会长、中华医学会常务理事……

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    杨维中

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    周晓农

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    曹彬

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    陈祥生

    博士研究生学历,研究员,博士研究生导师,现任中国疾病预防控制中心性病控制中心副主任,主要从事性病艾滋病的防治策略和流行病学研究工作。

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    陈瑜

    内科学博士,教授,博士生导师,浙江大学附属第一医院检验中心主任,中心实验室主任,传染病诊治国家重点实验室副主任。

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